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基因组重测序
低深度重测序
低深度重测序
简要概述
全染色体组低强度重测序(Low coverage WGS,LcWGS)指的是根据较低强度(~1×)的重测序信息实现隔代显性基因显性基因基因变异表观显性基因分型,然后使用染色体型选中,将低孔隙率信息选中为高孔隙率染色体型信息。LcWGS 不同系統设计,测序利润低,就能够修改全染色体组隔代显性基因显性基因基因变异,更有助于大新一轮模板的物理性质固定及 GS 繁育适用。
应用场景
01. 性状定位
动植物全基因组关联分析
02. 遗传评估
动植物全基因组选择育种
技术优势
  • 变异信息
    丰富
    可赚取全什么是基因组的基因遗传规律遗传变异
  • 高性价比
    以很低的测序利润低,得到聚集单位的标示,查测速度高
  • 大群体
    样本检测
    适用性于大群体心理的基因遗传型测量及科学研究
  • 分型
    准确性高
    特征提取自动填充计算方式,分几型更准率能达到98%
技术流程
优秀案例
低深度重测序--猪胴体分割性状及形态性状的遗传解析与基因组预测
本研究测定了长白、大白、长大二元以及杜长大三元猪4个群体的2,012头猪的17个分割肉性状和14个胴体性状。使用单倍型GWAS分析和基于基因型填充数据的GWAS分析分别鉴定到14个和112个与胴体分割性状极显著相关的QTLs。利用“中芯一号”芯片检测数据和基因型填充数据对这四个不同群体的分割肉性状和胴体性状进行全基因组选择研究。比较不同基因型数据、不同群体、以及不同预测模型对基因组预测准确性的影响。
图1 GWAS相对性状导航定位及GS结杲会比较
参考文献
Xie, L., Qin, J., Rao, L., Cui, D., Tang, X., Chen, L., Xiao, S., Zhang, Z., & Huang, L. (2023). Genetic dissection and genomic prediction for pork cuts and carcass morphology traits in pig. Journal of animal science and biotechnology, 14(1), 116.
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