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乌鳢
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产品介绍
中渔业实验深入分析院珠江渔业深入分析所赵建深入分析员技术团队与重庆康普森林果业科枝有现司携手开发建设了这款适当于乌鳢的靶点驯服选育基带基带集成块 ——“乌鳢50K选育基带基带集成块”。该基带基带集成块含有了50K个优质化量的SNPs位点,覆盖了与宝宝血型有关于的功用位点,适于于乌鳢全基因组组确定选育、新产类型引进、人群家系创建及系谱判定等基础框架深入分析。
产品设备信息 关键性叁数 乌鳢50K选育心片
标注产品信息 标上内型 SNP
标签数 50000
性别选择有关系位点 230
枝术的类型 康普森CAGT®靶向药物捉捕测序枝术
测序归类 上海、上海、山东、福建、河南、甘肃、津城、甘肃等各地乌鳢或是白乌鳢、金乌鳢
关联性dna组 GCA_033026475.1
应用方向
育种保种应用
全基因组选择育种
新品种培育
群体家系构建及系谱鉴定
基础研究
全基因组关联分析
选择信号分析
群体遗传进化分析
种质资源评估
数据表现
乌鳢50K育种芯片 — 染色体分布情况

图1 芯片位点在染色体上的分布图
乌鳢50K育种芯片 — MAF分布

图2 芯片位点MAF分布
乌鳢50K育种芯片 — 位点注释情况

图3 芯片位点注释情况

乌鳢50K育种芯片 — PCA比较分析

下图为根据群体原始基因型获得的PCA(左图),下图为根据芯片SNP位点获得的PCA(右图),样本聚集情况在二者中表现基本一致,说明该芯片可较好地代表群体原始状况。