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罗氏沼虾
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产品介绍
我国鱼业科学有效科学研制所招聘珠江鱼业科学研制所谈水虾隔代隐性人类遗传的基因制种信息化组于凌云探析分析生科学研制组织与首都康普森农牧业网络有限责任平台合作共赢,借助康普森CAGT®靶点阻止测序枝术,研制了兼有自动理论知识不动产证的罗氏沼虾200K靶点阻止制种心片“臻珠2号”。“臻珠2号”兼有什么是人类遗传的基因组涵盖全方面、总成本预算又、成果好、准确度率高等学校亮点,可软件于罗氏沼虾隔代隐性人类遗传的基因多种生物多样性监测、种质材料签别、功效什么是人类遗传的基因挖矿与什么是人类遗传的基因组的选择制种等科学研制,即为罗氏沼虾隔代隐性人类遗传的基因种质材料的研发与借助能提供最新消息的原子道具。借助“臻珠2号”可教育培养出罗氏沼虾的新商明细,进这一步下降育种总成本预算,为教育培养出发芽快、抵抗(逆)强、产品好的罗氏沼虾新商明细逐步形成核心。
单片机芯片内容 关键因素参数指标 臻珠6号
符号数据 标记符号品类 SNP
标识个数 200000
技能位点 22
测序的品种 不相同地理环境源于的237只罗氏沼虾
表1 “臻珠1号”育种芯片位点组成及分布数量
应用方向
罗氏沼虾遗传多样性评估
罗氏沼虾种质资源鉴定
罗氏沼虾全基因组选择育种
罗氏沼虾全基因组关联分析
数据表现
研究团队先后在越南、缅甸、斯里兰卡、浙江、江苏、广西和广东等8个区域收集罗氏沼虾237只。为获得充足可供挖掘的基因组遗传变异位点,对这些样本开展了高深度重测序工作,最终获得24,421,454个SNP位点。在这些数据的基础上,结合研究团队前期研究得到的22个个体鉴定位点,最终筛选出200,000个罗氏沼虾核心SNP位点,这些位点均匀地分布在59条染色体上(图1),并表现出较高的遗传多样性(图2)。使用重测序得到的位点和臻珠1号的200K位点对部分样品分别进行聚类分析,结果显示样本聚集情况在二者中表现基本一致(图3),说明该芯片可较好地代表群体原始状况。
图1 臻珠1号SNP位点在染色体上的位置分布
图2 臻珠1号SNP位点的MAF分布

图3 不同位点集的进化树结果(上图200K,下图所有位点)