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乌鳢
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产品介绍
国内 水产海产品养殖物理学实验院珠江水产海产品养殖实验所赵建实验员队伍与长沙康普森农产品加工现代科技有限工厂工厂连合开发设计了几款可以于乌鳢的靶向药物捕捉到选育处理器 ——“乌鳢50K选育处理器”。该处理器涉及了50K个优质化量的SNPs位点,归属于了与单双眼皮相应的功能表位点,适用作于乌鳢全染色体组取舍选育、新款种繁育、群体行为家系勾勒及系谱检测等依据实验。
设备数据 核心性能参数 乌鳢50K繁育IC芯片
标志数据 标上类 SNP
标志总值 50000
同卵双胞胎有关于位点 230
水平多种类型 康普森CAGT®靶向治疗捕捉测序技术工艺
测序团体 河南、浙江省、河北、河北、广西、河南、石家庄、甘肃等省份乌鳢及白乌鳢、金乌鳢
参看基因遗传组 GCA_033026475.1
应用方向
育种保种应用
全基因组选择育种
新品种培育
群体家系构建及系谱鉴定
基础研究
全基因组关联分析
选择信号分析
群体遗传进化分析
种质资源评估
数据表现
乌鳢50K育种芯片 — 染色体分布情况

图1 芯片位点在染色体上的分布图
乌鳢50K育种芯片 — MAF分布

图2 芯片位点MAF分布
乌鳢50K育种芯片 — 位点注释情况

图3 芯片位点注释情况

乌鳢50K育种芯片 — PCA比较分析

下图为根据群体原始基因型获得的PCA(左图),下图为根据芯片SNP位点获得的PCA(右图),样本聚集情况在二者中表现基本一致,说明该芯片可较好地代表群体原始状况。